Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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NFIXQ14938 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NFIXQ14938 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NFIXQ14938 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NFIXQ14938 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NFIXQ14938 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NFIXQ14938 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIXQ14938 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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