Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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