Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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