Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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