Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CRADD-207ENST00000550030 824 ntTSL 315.33■□□□□ 0.042e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CRADD-204ENST00000548330 1470 ntTSL 315.03■□□□□ -02e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-212ENST00000589834 591 ntTSL 214.77□□□□□ -0.052e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-206ENST00000587374 480 ntTSL 414.52□□□□□ -0.092e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-210ENST00000589241 557 ntTSL 214.48□□□□□ -0.092e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 TUBA1A-207ENST00000550767 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-218ENST00000593002 610 ntTSL 413.56□□□□□ -0.242e-10■■□□□ 11.8
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PABPC4Q13310 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-10■■□□□ 11.8
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PABPC4Q13310 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.392e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 IFRD1-215ENST00000489994 1721 ntTSL 1 (best)6.11□□□□□ -1.432e-10■■□□□ 11.8
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PABPC4Q13310 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 316.3■□□□□ 0.24e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 BIRC5-206ENST00000589892 747 ntTSL 218.68■□□□□ 0.582e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.448e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.788e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PDCD4-211ENST00000498367 975 ntTSL 38.28□□□□□ -1.088e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 EEF2-202ENST00000594885 580 ntTSL 224.99■■□□□ 1.597e-70■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.442e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CREG1-202ENST00000466652 794 ntTSL 39.89□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.272e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-17■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 SMDT1-203ENST00000484235 556 ntTSL 1 (best)31.71■■■□□ 2.671e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.732e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 MAPKAPK3-204ENST00000451680 873 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.332e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-23■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-23■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 YWHAQ-205ENST00000474715 709 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-23■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-204ENST00000562792 542 ntTSL 417.27■□□□□ 0.366e-7■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.416e-7■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 EEF1D-232ENST00000530445 1217 ntTSL 217.81■□□□□ 0.445e-10■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-60■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.384e-10■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.424e-10■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.073e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 MFSD12-214ENST00000615073 986 ntTSL 324.73■■□□□ 1.553e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 MFSD12-203ENST00000398558 1014 ntTSL 222.79■■□□□ 1.243e-6■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.353e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.273e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.563e-9■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.433e-9■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SNRPE-206ENST00000483099 967 ntTSL 224.2■■□□□ 1.463e-38■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.733e-38■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-38■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.343e-38■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.92□□□□□ -1.463e-38■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.734e-6■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.689e-10■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.039e-10■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-202ENST00000585423 494 ntTSL 232.15■■■□□ 2.743e-7■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-203ENST00000586497 573 ntTSL 331.52■■■□□ 2.643e-7■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.125e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 S100A11-202ENST00000478109 557 ntTSL 35.42□□□□□ -1.545e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SKIV2L2-208ENST00000508716 2185 ntTSL 210.24□□□□□ -0.771e-17■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-17■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 24.61□□□□□ -1.671e-17■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 UBL5-203ENST00000588141 573 ntTSL 424.98■■□□□ 1.596e-11■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 515.18■□□□□ 0.024e-10■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 BAG6-258ENST00000464126 609 ntTSL 217.64■□□□□ 0.419e-8■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.864e-7■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.254e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 FN3KRP-207ENST00000574832 1422 ntTSL 222.81■■□□□ 1.244e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TBC1D7-208ENST00000421203 1544 ntTSL 222.63■■□□□ 1.214e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.194e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.184e-12■■□□□ 11.7
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