Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms