Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms