Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms