Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms