Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms