Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms