Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms