Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms