Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAV3P56539 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAV3P56539 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CAV3P56539 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAV3P56539 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAV3P56539 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAV3P56539 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAV3P56539 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAV3P56539 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAV3P56539 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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