Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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