Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms