Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT10P13645 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT10P13645 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT10P13645 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT10P13645 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT10P13645 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT10P13645 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms