Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms