Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms