Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms