Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms