Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms