Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CCL27Q9Y4X3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CCL27Q9Y4X3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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