Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms