Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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