Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms