Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms