Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms