Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFGAP3Q9NP61 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms