Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms