Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms