Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF138Q8WVD3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RNF138Q8WVD3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RNF138Q8WVD3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF138Q8WVD3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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