Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTC29Q8NA56 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTC29Q8NA56 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTC29Q8NA56 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTC29Q8NA56 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTC29Q8NA56 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms