Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NAGSQ8N159 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAGSQ8N159 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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