Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms