Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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