Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCK2Q16822 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCK2Q16822 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCK2Q16822 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCK2Q16822 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms