Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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