Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GRIK4Q16099 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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