Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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TRIP13Q15645 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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