Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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