Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms