Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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