Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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DDX39BQ13838 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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DDX39BQ13838 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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DDX39BQ13838 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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