Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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