Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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