Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms