Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms