Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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