Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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